江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析  

Analysis of full-length segment S gene sequence of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolated in Jiangsu Province

作　　者：董梅 姚学君 马永法[1] 

机构地区：[1]盐城市盐都区疾病预防控制中心,江苏盐城224005 [2]盐城市疾病预防控制中心

出　　处：《预防医学》2019年第1期65-67,共3页CHINA PREVENTIVE MEDICINE JOURNAL

摘　　要：目的分析江苏省新型布尼亚病毒(SFTSV)分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据。方法通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源性。结果获取江苏省上传的35株SFTSV毒株基因信息,毒株分离年份为2010—2014年,主要为人源毒株,有28株,占80.00%。基因亚型主要为C4和C2,分别有16和14株,分别占45.71%和40.00%。35株SFTSV毒株全长S片段基因核苷酸序列同源性百分比为94.38%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.42%~100.00%;35株毒株与各亚型参考毒株间核苷酸序列同源性百分比为94.11%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.18%~100.00%;人源毒株与宿主动物分离株间核苷酸和氨基酸同源性为94.74%~99.91%和91.42%~99.80%。结论江苏省SFTSV分离株序列间亲缘性较近,其核苷酸和氨基酸高度同源。

关 键 词：新型布尼亚病毒 全长S片段基因 分子流行病学 同源性 

分 类 号：R373[医药卫生—病原生物学]