基于模式匹配算法的转基因大豆DNA快速检测方法  被引量:1

A Rapid DNA Detection Method for Transgenic Soybean Based on Pattern Matching Algorithm

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作  者:杨萍[1] 王海清 王宇 岳江涛 YANG Ping;WANG Haiqing;WANG Yu;YU Jiangtao(College of Information and Electrical Engineering,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110866,China)

机构地区:[1]沈阳农业大学信息与电气工程学院,沈阳110866

出  处:《农业科技与装备》2018年第6期22-24,共3页Agricultural Science & Technology and Equipment

基  金:沈阳农业大学教育教学研究立项;个性化;国际化教学在留学生课堂教育教学中的研究与实践(2018-39)

摘  要:为实现基因大豆DNA序列的快速检测,以抗草甘膦转基因大豆的DNA序列为材料,比较模式匹配的KMP算法和BF算法查找相同基因的效率和准确性。对比试验结果表明,KMP算法的效率比BF算法效率高,能够提高转基因大豆的检测效率。In order to realize the rapid detection of soybean DNA sequence, the DNA sequence of glyphosate-resistant transgenic soybean was used as the material to compare the efficiency and accuracy of pattern matching KMP algorithm and BF algorithm to find the same gene. The results show that KMP algorithm is more efficient than BF algorithm and can improve the detection efficiency of transgenic soybean.

关 键 词:基因匹配 抗草甘膦转基因大豆 DNA序列 BF算法 KMP匹配算法 

分 类 号:TS207.3[轻工技术与工程—食品科学] S565.1[轻工技术与工程—食品科学与工程]

 

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