不同海拔拉萨裸裂尻线粒体16S rRNA基因序列变异及遗传多样性分析  

Sequence variations and genetic differentiations in 16S rRNA gene in Schizopygopsis younghusbandi at different altitude levels

作　　者：周建设 曾本和[1] 王且鲁 王万良 牟振波 王金林 张驰 Zhou Jian-she;Zeng Ben-he;Wang Qie-lu

机构地区：[1]西藏自治区农牧科学院水产科学研究所,西藏拉萨850000 [2]河南农业大学牧医工程学院,河南郑州450046

出　　处：《水产科技情报》2019年第3期130-134,共5页Fisheries Science & Technology Information

基　　金：西藏自治区自然科学基金项目(2016ZR-NK-14);农业部公益性行业专项(201403012)

摘　　要：为了研究拉萨裸裂尻鱼(Schizopygopsis younghusbandi)的种群遗传多样性,为该鱼的资源保护和养殖提供科学依据,对采自雅鲁藏布江4个海拔江段的33尾拉萨裸裂尻鱼样本的线粒体16S rRNA基因片段进行扩增测序,计算遗传距离、核苷酸位点变异、核苷酸多样性和单倍型多样性,构建单倍网络图和系统发育树。经检测,33个样本均获得有效16S rRNA基因扩增片段,片段大小为563 bp,从33个个体中共检出8种单倍型,其中海拔为4 565 m的拉萨裸裂尻9尾,4个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 002 07和0. 833,平均核苷酸差异数最大,为1. 167;海拔为4 005 m的拉萨裸裂尻10尾,4个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 001 89和0. 644,平均核苷酸差异数为1. 067;海拔为3 609 m的拉萨裸裂尻10尾,2个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 000 71和0. 378,平均核苷酸差异数最小,为0. 400;海拔为2 909 m的拉萨裸裂尻4尾,1个变异位点,核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0. 000 89和0. 500,平均核苷酸差异数为0. 500。分析结果表明,拉萨裸裂尻不同海拔种群的遗传多样性与其相应海拔的人类干预程度呈负相关。

关 键 词：拉萨裸裂尻 海拔 16SrRNA 遗传多样性 

分 类 号：S917.4[农业科学—水产科学]