海南五指山猪TLR4基因克隆及生物信息学分析  

Cloning and bioinformatics analysis of TLR4 gene in Wuzhishan pig from Hainan Province

作　　者：黄丽丽 张艳 刘海隆 林哲敏[1,2] 谭树义 

机构地区：[1]海南省农业科学院畜牧兽医研究所,海南海口571100 [2]海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室,海南海口571100

出　　处：《江苏农业科学》2019年第8期41-46,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金(编号:31560696);海南省农业科学院农业科技创新专项(编号:CXZX201504);海南省自然科学基金(编号:20153080)

摘　　要：为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征,以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列,采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果显示,获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10 435 bp,其中编码区全长2 526 bp,共编码841个氨基酸;与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比,存在38处突变(其中有2处突变位于编码区);与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9%、80.7%、79.9%、74.8%、74.7%、73.1%、73%、72.7%、62.5%、43.4%;五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白,具有亲水性,有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点;氨基酸系统进化树分析表明,不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性。该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础。

关 键 词：五指山猪 TLR4基因 克隆 生物信息学分析 

分 类 号：S828.1[农业科学—畜牧学] Q785[农业科学—畜牧兽医]