甜瓜全基因组R2R3MYB转录因子基因的识别与分析  被引量:1

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作  者:张爽爽 陈莹[1] 张金鹏[1] 耿伟[1] 王利波[1] 惠长敏 

机构地区:[1]吉林省蔬菜花卉科学研究院,130033

出  处:《吉林蔬菜》2019年第2期48-52,共5页

摘  要:R2R3MYB转录因子是MYB转录因子家族的一大亚类,广泛地参与植物生长发育及抵御逆境等生理过程。本文以甜瓜基因组数据为研究对象,发掘甜瓜基因组中的R2R3MYB转录因子并对其进行生物信息学分析。研究结果表明:甜瓜全基因组中含有70个具有典型结构域的R2R3MYB转录因子,蛋白序列含有氨基酸个数为166~553个不等,蛋白序列中含有保守的基序(motifs)及氨基酸位点;通过与拟南芥基因组中R2R3MYB转录因子构建亲缘进化树,对甜瓜的70个R2R3MYB转录因子基因功能进行了初步的预测。

关 键 词:甜瓜 R2R3MYB转录因子 生物信息学分析 

分 类 号:Q943.2[生物学—植物学]

 

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