一株临床耐药菌高通量测序数据的深度挖掘  

作　　者：傅行礼 郑学明 解冰 刘永平 高玉华 吴晓蓉 孔德华 

机构地区：[1]江苏大学医学部,江苏镇江212001 [2]镇江市丹徒区中医院 [3]南京市高淳人民医院

出　　处：《中国老年学杂志》2019年第12期3033-3037,共5页Chinese Journal of Gerontology

基　　金：镇江市丹徒区社会发展项目(SH20160103);江苏大学医学临床科技发展基金(JLY20160222)

摘　　要：目的通过分析一株临床耐药菌高通量测序的数据,探讨从二代测序原始数据中挖掘提取有用信息的流程。方法综合利用主流生物信息学软件,筛选可能和耐药有关的突变位点。结果通过对基因组测序数据的处理和从头组装,得到该菌株基因组的基本特征、进化关系及可能和抗药性有关的突变位点。结论随着高通量测序技术的发展,临床分离出的致病菌的测序已经成了常规的研究技术。通过对测序数据的深度挖掘,将为临床研究致病菌的致病和耐药机制提供更有价值的线索。

关 键 词：临床致病菌 高通量测序 致病机制 耐药机制 深度挖掘 

分 类 号：R378.2[医药卫生—病原生物学]