保加利亚乳杆菌N-乙酰胞壁质酶基因的克隆及生物信息学分析  

Cloning and bioinformatics analysis of Lactobacillus bulgaricus N-acetylmuramidase gene

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作  者:苏文政[1] 吴家强[1] 马建军[1] 黄保华[1] 蒋慧 王可[1] 张玉玉[1] Su Wenzheng

机构地区:[1]山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室,山东济南250100 [2]山东省食品药品检验研究院,山东济南250101

出  处:《江苏农业科学》2019年第15期99-102,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:山东省农业科学院青年科研基金(编号:2015YQN52、2016YQN55);山东省农业重大应用技术创新项目[编号:农指(2014)38号];济南市金种子企业关键产品提升计划(编号:201502069)

摘  要:为了研究保加利亚乳杆菌N-乙酰胞壁质酶基因的结构特征及编码蛋白的功能,根据GenBank中其基因的DNA序列设计引物,以保加利亚乳杆菌MN株的基因组为DNA模板,利用PCR技术扩增N-乙酰胞壁质酶基因,将其克隆到pMD-19T载体上,进行测序与生物信息学分析。结果表明,MN株N-乙酰胞壁质酶基因序列编码217个氨基酸,与GenBank中公开的N-乙酰胞壁质酶基因核苷酸序列的同源性为98.8%~100.0%;蛋白质的理论分子质量为24.55ku,理论等电点为9.83;该蛋白属于亲水性蛋白,二级结构以α-螺旋为主;该蛋白的第16~38位氨基酸残基组成跨膜区,第56~216位氨基酸残基组成LYZ2结构域。研究结果为今后探讨N-乙酰胞壁质酶基因的生物学功能及其功能改造奠定了基础。

关 键 词:保加利亚乳杆菌 N-乙酰胞壁质酶 克隆 生物信息学分析 

分 类 号:S182[农业科学—农业基础科学]

 

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