细菌基因组结构:识别种系群的分子标志(英文)  

Bacterial genome structure: a molecular marker to reveal phylogenetic clusters

作　　者：刘树林[1] 刘桂荣[1] 李绍贤[2] 刘葳峤[3] 郑君芳[4] 朱万孚[4] 谷鸿喜[2] 郭晓奎[2] 马佳毓[2] K.E.Sanderson 周宇光[5] R.N.Johnston 

机构地区：[1]加拿大卡尔加里大学医学院微生物系 [2]哈尔滨医科大学微生物学教研室 [3]加拿大卡尔加里大学生物系 [4]北京大学基础医学院微生物系 [5]中国科学院微生物研究所 [6]加拿大卡尔加里大学医学院生物化学系

出　　处：《北京大学学报（医学版）》2002年第5期457-463,共7页Journal of Peking University:Health Sciences

基　　金：anoperatinggrantfromtheMedicalResearchCouncilofCanada (MRC ;Grant #GOP 3 810 6)toLiuShu Lin ;anoperatinggrantfromtheNaturalSciencesandEngineeringResearchCouncilofCanada (NSERC ;Grant #2 16912 0 0 )toLiuShu Lin ;anoperatinggrantfromtheCanadi an

摘　　要：目的 :评价细菌基因组结构作为种系标志在细菌亲缘关系识别中的应用。方法 :本研究选用 3个属的细菌 :Klebsiel la ,Neisseria以及Vibrio。为得到完整的基因组DNA ,整个提取的操作过程都在琼脂糖凝胶中进行。经proteinaseK除蛋白后 ,基因组DNA置于TE缓冲液中待用。内切酶Ⅰ CeuⅠ是本研究中主要的工具酶。酶切后的基因组DNA经脉冲场电泳分离。结果 :Klebsiella的所有菌株 (两个种 ,即Klebsiellapneumoniae和Klebsiellaoxytoca)都有一个共同的基因组结构 ,而这一“Klebsiella基因组结构”与Escherichiacoli或Salmonella的基因组结构很相似 ,其主要不同之处有 3点 :(1)有 8个rrn操纵子 (Escherichiacoli和Salmonella各有 7个 ) ;(2 )基因组较大 ;(3)Ⅰ CeuⅠE片段易位。以往学术界认为Neisseria具有高度易变和多态的基因组结构。而我们的研究结果表明 ,Neisseria的基本基因组结构是相对稳定的。我们比较研究了 30 0株N .meningitidis,结果仅仅发现了少数几个不同的基因组结构。其中Z2 4 91株代表 5 0 %的群体 (Ⅰ型基因组结构 ) ,MC5 8株代表 2 0 %的群体 (Ⅱ型基因组结构 ) ,N0 4 5株代表 17%的群体 (Ⅲ型基因组结构 )。已知Z2 4 91和MC5 8代表不同的种系群 。

关 键 词：基因结构 种系群 I-Ceu I 

分 类 号：Q939.1[生物学—微生物学]