梅花鹿SNX10基因cDNA克隆与序列分析  

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作  者:刘娜[1] 张浩波 王皓珺 高悦禹 李和平[1] 夏彦玲[1] 

机构地区:[1]东北林业大学

出  处:《黑龙江畜牧兽医》2019年第21期158-160,163,179,180,共6页Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine

基  金:中国博士后科学基金项目(20110491124);黑龙江省东北林业大学大学生创新训练项目(201810225382)

摘  要:为了获得梅花鹿SNX10基因编码区cDNA序列,试验提取了梅花鹿鹿茸尖端组织总RNA,设计上下游引物,利用PCR技术扩增SNX10基因,对扩增的基因进行氨基酸序列分析并构建系统进化树。结果表明:扩增获得的序列为854 bp,其中包括606 bp开放阅读框(ORF),编码201个氨基酸;SNX10蛋白为疏水性蛋白质且存在信号肽和跨膜结构,由α-螺旋、扩展链、无规则卷曲组成,蛋白亚细胞定位预测为细胞质。梅花鹿鹿茸SNX10蛋白氨基酸序列与白尾鹿的同源性极高,为99%。梅花鹿与白尾鹿的亲缘关系最近,与野猪、牛的亲缘关系较近,与人、白鳍豚、裸鼹鼠、黑猩猩、赤狐、刺猬的亲缘关系较远。

关 键 词:梅花鹿鹿茸 SNX10基因 CDNA克隆 PCR技术 生物信息学分析 

分 类 号:S825[农业科学—畜牧学] Q785[农业科学—畜牧兽医]

 

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