MALDI-TOF MS分值低于2.0的葡萄球菌鉴定结果评价及改进方法  被引量:3

Evaluation and improvement of staphylococcal identification results with MALDI-TOF MS score less than 2.0

在线阅读下载全文

作  者:李亚楠 王玫[1] 黄艳飞[1] 隋文君[1] 孙宇峰[1] 曹晶晶[1] 张桂[1] 顾海彤[1] 鲁辛辛[1] Li Yanan;Wang Mei;Huang Yanfei;Sui Wenjun;Sun Yufeng;Cao Jingjing;Zhang Gui;Gu Haitong;Lu Xinxin

机构地区:[1]首都医科大学附属北京同仁医院检验科,北京100730

出  处:《中华检验医学杂志》2019年第11期972-975,共4页Chinese Journal of Laboratory Medicine

摘  要:目的提高基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定葡萄球菌的能力。方法收集首都医科大学附属北京同仁医院2017年9月至2018年6月分离自临床标本(血液、尿液、脑脊液、胸腔积液、腹腔积液等)的葡萄球菌中临床鉴定分值低于2.0的菌株110株,选用Bruker microflex仪器和biotyper软件重新进行直接点靶法和提取法鉴定,以16S rRNA基因、延长因子(tuf)基因测序为"金标准"。对仍低于2.0的菌株,生成主要谱峰图(MSP),并与数据库同种菌株的MSP进行树状图分析,计算相对进化距离。结果经重新直接点靶法鉴定,78.18%(86/110)的菌株鉴定分值达到2.0;经提取法鉴定,94.55%(104/110)的菌株鉴定分值达2.0,通过卡方检验分析,提取法优于直接点靶法(χ^2=12.505,P<0.001),但仍有5.45%(6/110)鉴定分值低于2.0,测序结果(质谱鉴定结果)分别为:巴氏葡萄球菌(巴氏葡萄球菌1.803)、缓慢葡萄球菌(缓慢葡萄球菌1.885)、孔氏葡萄球菌(孔氏葡萄球菌1.876)、模仿葡萄球菌(模仿葡萄球菌1.979)、佩滕科夫葡萄球菌(佩滕科夫葡萄球菌1.845)、鸡葡萄球菌(无鉴定结果)。结论对于葡萄球菌,鉴定分值为1.7~2.0,且显示为同种,可报告至种水平。直接点靶法标准化可提高葡萄球菌鉴定可信度。若提取法未能鉴定到种,需自建库,或通过增加菌株优化数据库。

关 键 词:葡萄球菌属 光谱法 质量 基质辅助激光解吸电离 

分 类 号:R44[医药卫生—诊断学]

 

参考文献:

正在载入数据...

 

二级参考文献:

正在载入数据...

 

耦合文献:

正在载入数据...

 

引证文献:

正在载入数据...

 

二级引证文献:

正在载入数据...

 

同被引文献:

正在载入数据...

 

相关期刊文献:

正在载入数据...

相关的主题
相关的作者对象
相关的机构对象