拉萨野生棕色蘑菇的全基因组测序  

作　　者：郭晓飞 汪艳 德吉 牟涛 李俊 秦强 杨满军[2] 

机构地区：[1]拉萨市高原生物研究所 [2]西藏职业技术学院,西藏拉萨850030

出　　处：《西藏科技》2019年第12期17-21,共5页Xizang Science And Technology

基　　金：西藏自治区重点研发及转化计划项目“关于拉萨野生棕色蘑菇资源挖掘与开发”(XZ201801NB23)

摘　　要：本研究采用Illumina Hiseq二代测序和GridION Nanopore纳米孔三代测序结合对拉萨市野生棕色蘑菇进行基因组测序获得4083207300bp的原始数据,数据经过处理后,拼接获得18条完整的染色体,开放阅读框和基因数为3798个,合计30069126bp,最小的染色体长度为46397bp,最大的3600717bp,全基因组的GC含量为46.53%,每条染色体平均长度为1.67Mbp。利用KOG对3798个基因进行功能注释,主要分为24类功能。同时使用MISA程序对参考基因组序列中的微卫星重复位点进行分析,得到3134个微卫星标记位点。

关 键 词：拉萨棕色蘑菇 全基因组 测序 

分 类 号：S646.11[农业科学—蔬菜学]