贵州兴义鸭线粒体DNA条码分析  

作　　者：廖朝美 李万贵 谭光辉 李杰章 覃媛钰 吴磊 游敏芳 张依裕 

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025 [2]六盘水市草地工作站,贵州六盘水553001

出　　处：《畜禽业》2020年第2期1-4,共4页Livestock and Poultry Industry

基　　金：贵州大学博士基金“兴义鸭遗传特性的综合评价”[贵大人基合字(2010)037号];贵州省高层次创新型人才培养项目[Z174008]。

摘　　要：目的试验旨在通过对贵州兴义鸭进行深入研究,利用COI基因序列作为DNA条形码对兴义鸭进行分子鉴定,分析其遗传多态性并探讨DNA条形码在贵州鸭品系分子鉴定工作的可行性和有效性。方法以41只兴义鸭为研究对象,利用DNA直接测序法测定DNA条形码区COI基因序列,MEGA 6软件和Chromas软件筛查COI基因多态位点,然后DNASP 5软件计算COI基因的遗传特性评价指标。结果兴义鸭COI基因存有8个多态位点,分别是G92A、G98A、A296G、C308T、G350A、G407A、T437C和A674G;共检测到12种单倍型GAACGGTA、AAGTAACG、GAACAGTA、AGGTAACG、AGGTAGCG、AAACGGCA、AAACGGTA、AAATAACG、AACCAGCG、AAGTGGCA、AAATGGCA和AAGTAGCG;平均单倍型多样度为0.837,12种单倍型的遗传距离范围为0.002~0.012,平均遗传距离为0.005,Tajima's D(中性检验值)值为2.90350,统计显著性达到极显著水平(P<0.01),不符合中性突变。兴义鸭中12种单倍型共分为3个分支,其中第11种单倍型独成一个分支,单倍型2、4、5、8、9、10、12作为别一支,单倍型1、3、6、7作为另一分支,且该分支与GenBank中的6个家鸭品种共为一支。兴义鸭12种单倍型与融水鸭、西林鸭、绍兴鸭、北京鸭、龙盛鸭和建昌鸭无交叉的现象。结论COI基因序列可以作为DNA条形码对贵州兴义鸭进行分子鉴定,能够将贵州兴义鸭和其他品种鸭品系区分开来,从而鉴定出兴义鸭。

关 键 词：兴义鸭 线粒体DNA DNA条码 品系鉴定 

分 类 号：TP3[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]