NaHCO3胁迫下吉尔吉斯白桦MADS基因家族生物信息学及表达分析  

Bioinformatics and expression analysis of MADS gene family in Betula kirghisorum under NaHCO 3 salt stress

作　　者：刘伟莹 张雨晴 王丹玉 李佳妮 杨成君[1] Liu Weiying

机构地区：[1]东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨150040

出　　处：《江苏农业科学》2020年第10期85-93,共9页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：东北林业大学大学生创新训练项目(编号:201810225478)。

摘　　要：为了探索MADS基因家族的耐盐胁迫功能,从以吉尔吉斯白桦(Betula kirghisorum)23号为试验材料测得的转录组文库中筛选出28个吉尔吉斯白桦的MADS-box基因序列对其编码蛋白的基本理化性质、亚细胞定位、二级结构、跨膜结构和信号肽、基因结构、保守基序、蛋白系统进化等方面进行初步生物信息学分析,并在NaHCO3胁迫下对其表达情况进行分析。结果显示,除蛋白BkMADS1和BkMADS20外,其余均为亲水性蛋白;在28个吉尔吉斯白桦MADS蛋白中有19个定位在细胞核中;蛋白BkMADS7和BkMADS12的二级结构组成以无规则卷曲为主,其余蛋白则以α-螺旋为主;所有蛋白均没有信号肽,即全为非分泌性蛋白。此外,进化分析结果表明,MADS盒为MADS-box转录因子高度保守的结构域,大多数吉尔吉斯白桦MADS蛋白为Ⅱ型。在0.6%NaHCO3胁迫下,15个BkMADS基因上调表达,13个BkMADS个基因下调表达。

关 键 词：吉尔吉斯白桦 MADS基因家族 MADS-box转录因子 转录组文库 非分泌性蛋白 生物信息学 NaHNO3胁迫 基因表达 

分 类 号：Q943.2[生物学—植物学] R857.3[医药卫生—航空、航天与航海医学]