牦牛TAP基因编码区的克隆与序列分析  

Cloning and sequence analysis of TAP gene coding region of yak

作　　者：周晓舟 刘静怡 程运谋 杨修竹 闫睿 武新学 彭忠利[1] 高彦华[1] ZHOU Xiaozhou;LIU Jingyi;CHENG Yunmo;YANG Xiuzhu;YAN Rui;WU Xinxue;PENG Zhongli;GAO Yanhua

机构地区：[1]西南民族大学生命科学与技术学院/青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都610041

出　　处：《黑龙江畜牧兽医》2020年第10期110-115,120,153,共8页Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine

基　　金：四川省重点研发项目(2017NZ0042);国家现代农业产业技术体系四川省肉牛创新团队(sccxtd-2020-13)。

摘　　要：为了克隆和分析牦牛气管抗菌肽(yTAP)基因的编码区序列(CDS),并分析其序列特征和检测其mRNA的组织表达规律,试验采集2.5岁的健康公牦牛(n=6)和母牦牛(n=6)的气管、肝脏、脾脏、肾脏、肺脏、结肠和性腺共7种组织样品,反转录(RT)-PCR法克隆了气管组织yTAP基因编码区序列,对其进行序列生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR法检测yTAP基因mRNA的组织表达规律。结果表明:克隆得到的yTAP基因编码区序列全长为195 bp,编码含有64个氨基酸残基的TAP前体肽,第27~64位的氨基酸构成了yTAP成熟肽序列。yTAP成熟肽含有6个半胱氨酸和3个脯氨酸,形成3对二硫键,二级结构由α螺旋、延伸链和无规则卷曲三种结构组成;SWISS-MODEL预测三级结构结果表明,yTAP成熟肽三级结构主要是延伸链和无规则卷曲,并且在C-端存在一段螺旋结构。蛋白质稳定性较好,具有两亲性,属于β防御素家族成员。yTAP基因在牦牛气管组织中表达水平最高。说明本试验成功克隆获得了yTAP基因的编码区序列,且mRNA主要在气管组织中表达。

关 键 词：牦牛 抗菌肽 TAP 序列分析 MRNA 表达规律 

分 类 号：S823.89[农业科学—畜牧学] Q78[农业科学—畜牧兽医]