2016—2018年我国华北部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的遗传变异分析  被引量:8

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作  者:朱国坡 马凤龙 王家福 刘金华[1] 

机构地区:[1]中国农业大学动物医学院,北京100193 [2]杭州佑本动物疫苗有限公司,浙江杭州310018

出  处:《黑龙江畜牧兽医》2020年第11期96-100,共5页Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine

基  金:浙江省重点研发计划项目(2019C02043)。

摘  要:为了了解2016—2018年华北部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的遗传变异情况,试验采用RT-PCR方法对采集的临床疑似猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)样品进行检测,然后对阳性样品进行开放阅读框5(ORF5)基因扩增和测序,并对获得毒株ORF5基因的核苷酸序列和推导氨基酸序列进行同源性分析,以及推导氨基酸序列的遗传变异分析。结果表明:所采集的198份临床疑似PRRS样品中有114份RT-PCR检测结果为阳性,阳性率为57.58%;测序共获得37条ORF5基因序列;所获毒株与基因Ⅱ型代表毒株ORF5基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为82.6%~99.5%、81.0%~99.5%;全部PRRSV毒株均为基因Ⅱ型,分属于Linage 1(代表毒株为NADC30)、Linage 5(代表毒株为VR-2332)和Linage 8(代表毒株为JXA1)3个亚群,其中Linage 1占比最高,为78.38%;各亚群毒株均具有各自特征性氨基酸,在非中和表位区域(aa27~30)的全部氨基酸均可发生突变,Linage 1亚群的HeBxtsh-1808株在胞外域存在1个氨基酸的插入。说明华北地区PRRSV流行毒株呈多样化,而且不断发生变异,类NADC30已成为该地区的优势流行毒株,提示应根据当地的流行情况及时调整该病的防控方案。

关 键 词:猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus PRRSV) 开放阅读框5(ORF5) 华北 遗传变异 突变 插入 

分 类 号:S852.659.6[农业科学—基础兽医学] Q786[农业科学—兽医学]

 

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