蔓花生AP2基因家族的生物信息学分析  

Bioinformatics analysis of AP2 gene family in Arachis duranensis

作　　者：王玲 刘晓伟 江纳 付春 Wang Ling

机构地区：[1]乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室,四川乐山614000 [2]乐山师范学院生命科学学院,四川乐山614000 [3]乐山师范学院数学与信息科学学院,四川乐山614000

出　　处：《江苏农业科学》2020年第14期65-77,共13页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：四川省科技厅项目(编号:17ZZ019);乐山师范学院人才启动项目(编号:XJR17005)。

摘　　要：AP2作为一类植物转录因子,在花的发育和营养器官的形成过程中都起着非常重要的作用。旨在对蔓花生(Arachis duranensis)AP2蛋白的理化性质及分子进化关系等进行详细的生物信息学分析。结果表明,蔓花生AP2基因家族成员编码蛋白亚细胞定位预测均在细胞核中,有11个成员的理论等电点小于7,推测该家族蛋白多为酸性蛋白,有8个成员存在2个保守结构域;该家族成员均无信号肽;除了Aradu.SE6Q0与Aradu.42K79成员中存在跨膜现象外,其他成员鲜少出现跨膜现象。亲疏水性预测结果表明,蔓花生AP2基因家族编码蛋白的亲疏水性系数均小于0,推测其为亲水蛋白;磷酸化位点主要集中在丝氨酸上;其二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。研究还得出,蔓花生AP2基因家族编码蛋白的主要保守基序是Motif1、Motif2和Motif4;Motif3、Motif4都含有YRG结构域,Motif5含有RAYD结构域;构建的系统发育树也有力地说明了AP2基因家族的进化程度。

关 键 词：蔓花生 AP2基因 基因家族 生物信息学 

分 类 号：S541.901[农业科学—作物学]