猪丹毒丝菌强毒株与弱毒疫苗株SpaA基因生物信息学分析  

Bioinformatics analysis of SpaA gene in Erysipelothrix virulent strain and attenuated vaccine strain

作　　者：袁晓晴 彭凌[1] 陈锦红 温权 刘博婷[1] 蔡巩林 Yuan Xiaoqing

机构地区：[1]韶关学院英东生命科学学院/粤北生猪生产及疫病防控协同创新发展中心,广东韶关512005

出　　处：《江苏农业科学》2020年第17期70-76,共7页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：广东省自然科学基金(编号:2017A030307041);广东省科技创新战略专项资金——“攀登计划”专项资金(编号:pdjh2020b0537)。

摘　　要：对猪丹毒丝菌SpaA蛋白进行生物信息学分析,并对比了猪丹毒丝菌弱毒菌株和野生强毒菌株间的差异。结果显示,由于猪丹毒丝菌GC42的SpaA蛋白缺少一段含有80个氨基酸的序列,使得该菌株的蛋白质相对分子质量、氨基酸组成、二级和三级结构与强毒株的SpaA蛋白质相比均有所差异,导致这2株菌株引发机体产生的免疫原性和抗原性强弱有所不同,推测这2株菌株中,SG7菌株的免疫原性相对GC42较强;GC42菌株的抗原性相对SG7菌株的抗原性来说较弱,而猪丹毒丝菌GC42菌株的毒力相对猪丹毒丝菌SG7菌株较弱,因此呈现弱毒菌株特性;推测2株菌株的氨基酸序列均在193~206、217~231、290~309、313~327、328~376、386~457区段具有较高的形成B细胞表位的可能性。

关 键 词：猪丹毒丝菌 SpaA蛋白 弱毒菌株 生物信息学分析 B细胞抗原表位 

分 类 号：S852.61[农业科学—基础兽医学]