兰坪乌骨绵羊PDGFRL基因编码区序列扩增及其生物信息学分析  

作　　者：彭超超 刘兴能 岳丹 朱俊红 熊和丽[1,2] 李静 和晓明[1] 席冬梅 邓卫东 

机构地区：[1]云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201 [2]云南省畜牧兽医科学院,云南昆明650201 [3]公安部昆明警犬基地,云南昆明650201

出　　处：《中国畜牧杂志》2020年第10期150-155,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家自然科学基金(31660634);国家重点研发计划(2018YFD0502100)。

摘　　要：本研究根据Genbank载入的普通绵羊血小板衍生生长因子受体样蛋白(PDGFRL)基因序列设计特异性引物。利用PCR技术扩增乌骨绵羊PDGFRL基因编码区片段,经测序后对序列进行比对分析,并采用生物信息学软件对编码区序列和蛋白质结构进行预测。结果表明:兰坪乌骨绵羊PDGFRL基因编码区序列全长1128 bp,编码375个氨基酸;同普通绵羊进行核苷酸序列同源性比对发现同源性为99.73%,发现3个碱基同义突变;生物信息学分析表明不同物种PDGFRL基因编码区核苷酸序列与氨基酸序列具有较高的保守性;蛋白结构预测显示,PDGFRL蛋白空间结构主要由α螺旋、β折叠和无规则卷曲构成。

关 键 词：乌骨绵羊 PCR扩增 PDGFRL基因 蛋白质结构预测 

分 类 号：S826.2[农业科学—畜牧学]