清水江斑鳜COI基因序列分析  

Sequence Analysis of COI Gene of Qingshuijiang Siniperca scherzeri

作　　者：余科 安苗[1] 黄胜[1] 潘秋芝 Yu Ke

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025

出　　处：《贵州畜牧兽医》2020年第5期5-10,共6页Guizhou Journal of Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基　　金：“苗岭山区斑鳜种质特性评价及其生长关联分子”国家自然科学基金项目(31660741)。

摘　　要：为了解清水江斑鳜的遗传多样性,试验采集清水江凯里江段和天柱江段2个站点的斑鳜种群个体51尾,利用PCR扩增技术进行细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因测序分析。结果:51个斑鳜样品中,COI基因序列长度为962 bp,共检测到9个多态位点,保守位点952个。其中转换、颠换的位点数分别有7个和2个,不存在转换与颠换共存的基因位点;碱基A+T和C+G的平均含量分别为53.3%和46.7%。清水江斑鳜单倍型多样度为0.65020,平均遗传距离为0.0026。凯里江段斑鳜样品中核苷酸多样性为0.00109,平均核苷酸差异数为1.04923;天柱江段斑鳜样品中核苷酸多样性为0.00131,平均核苷酸差异数为1.26000。51尾个体中包含9个单倍型,2个江段群体间存在共有同一单倍型的情况。在构建的邻接系统进化树中,51个斑鳜样品聚为1支,且置信度高,亲缘关系很接近;与另外8支参照斑鳜归为1支,亲缘关系较近。结论:清水江斑鳜的遗传多样性较为丰富,且2个群体的遗传谱系更接近于洞庭湖和鄱阳湖的斑鳜群体;其中天柱江段斑鳜的遗传多样性比凯里江段斑鳜高,遗传资源更为丰富。

关 键 词：清水江斑鳜 种质资源 COI基因序列 遗传多样性 

分 类 号：S932.4:Q78[农业科学—渔业资源]