二倍体和四倍体西瓜的转录组初步分析  被引量:5

Transcriptome analysis of diploid and tetraploid watermelon

在线阅读下载全文

作  者:许哲 张晨光 张思远[2] 王先裕[1] 高建昌[2] Xu Zhe

机构地区:[1]广西大学,广西南宁530001 [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081

出  处:《江苏农业科学》2020年第24期53-59,共7页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:中国农业科学院科技工程创新项目(编号:CAAS-ASTIPIVFCAAS);农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目。

摘  要:植物染色体加倍后的表型变化与基因的表达密切相关。本研究对1份二倍体和3份四倍体西瓜材料进行转录组测序并分析差异表达基因。结果表明,二倍体和四倍体西瓜的差异表达基因显著富集的GO term为细胞氮化合物生物合成过程、光系统、半胱氨酸型内肽酶抑制剂活性、氧化还原酶活性以及类囊体等,KEGG富集分析中发现差异表达基因在光合作用、光合作用天线蛋白、叶绿素和卟啉代谢、乙醛酸和二羧酸代谢等通路较为活跃。二倍体和四倍体西瓜中高水平差异基因大都是上调表达,氧化应激蛋白、脱落酸受体、乙烯响应转录因子等差异表达基因可能是西瓜多倍体形成的关键因子,对相关基因的深入研究有助于解析植物倍性变化的分子机制。

关 键 词:多倍体 西瓜 转录组 差异表达基因 GO富集分析 KEGG富集分析 

分 类 号:S651.01[农业科学—果树学]

 

参考文献:

正在载入数据...

 

二级参考文献:

正在载入数据...

 

耦合文献:

正在载入数据...

 

引证文献:

正在载入数据...

 

二级引证文献:

正在载入数据...

 

同被引文献:

正在载入数据...

 

相关期刊文献:

正在载入数据...

相关的主题
相关的作者对象
相关的机构对象