高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识  

Expert consensus on clinical standardized application of metagenomics next-generation sequencing for detection of pathogenic microorganisms

作　　者：中华医学会检验医学分会 鲁辛辛[2] 王成彬 王玫[2] 赵建玉 樊高威 杨瑞馥 任丽丽[7] 胡继红[8] 鲁炳怀 赵晓涛[10] 吴丽媛 隋文君[2] 周倩倩 Chinese Society of Laboratory Medicine;Lu Xinxin;Wang Chengbin

机构地区：[1]不详 [2]首都医科大学附属北京同仁医院检验科 [3]中国人民解放军总医院第一医学中心临床检验科 [4]首都医科大学 [5]首都医科大学附属北京朝阳医院检验科 [6]军事医学研究院微生物流行病研究所 [7]中国医学科学院病原生物学研究所 [8]北京医院国家老年医学中心卫生部临床检验中心 [9]中日友好医院临床微生物室与感染实验室 [10]北京大学人民医院检验科 [11]广州市妇女儿童医疗中心检验科

出　　处：《中华检验医学杂志》2020年第12期1181-1195,共15页Chinese Journal of Laboratory Medicine

基　　金：国家科技重大专项(2014ZX10004005,2018ZX10103001,2018ZX10102001);国家重点研发计划(2019YFC1200700)。

摘　　要：宏基因组下一代测序(mNGS)技术直接针对标本中核酸无偏倚检测病原微生物序列。但是,mNGS需经标本前处理、核酸提取、文库制备、上机测序、数据库比对、报告生成及结果解读等一系列过程,对技术平台及人员素质要求较高。为规范mNGS技术在感染性疾病诊断中的应用,提高危急重症、疑难感染性疾病和新发突发传染病的救治水平,在多项国家科技专项的支持下,本领域有关专家起草了本共识,以促进mNGS技术的规范应用和良性发展。Metagenome next-generation sequencing(mNGS)technique can directly target the nucleic acid in samples to detect the sequence of pathogenic microorganisms without any bias.However,mNGS needs to go through a series of processes,including sample collection,nucleic acid extraction,library preparation,sequencing,bioinformatic analysis and reporting.All these steps require qualified technical platforms and personnel.In order to standardize the application of mNGS technique in the diagnosis of infectious diseases and improve the treatment quality of critical,difficult and emerging infectious diseases,relevant experts in this field,with the support from many national scientific projects,have drafted this consensus,hoping to promote the standardized application and future development of the mNGS technique.

关 键 词：宏基因组下一代测序 感染性疾病 病原微生物 共识 

分 类 号：R446.5[医药卫生—诊断学]