基于数据挖掘比较慢性阻塞性肺疾病模型动物易感基因  

作　　者：刘迪[1,2] 张洪春[1] 李颖[1] 

机构地区：[1]中日友好医院中医肺病科,北京100029 [2]北京中医药大学,北京100029

出　　处：《中日友好医院学报》2021年第1期32-34,共3页Journal of China-Japan Friendship Hospital

基　　金：科技部重大新药创制科技重大专项(编号:2018ZX09721004)。

摘　　要：目的:分析常用慢性阻塞性肺疾病(慢阻肺)模型动物的易感基因差异,以优化选择造模动物。方法:在大鼠基因组数据库(RGD)检索人类、小鼠、大鼠等物种的基因组学数据,进行慢阻肺易感基因富集分析,通过Ensembl基因组数据库比较不同物种间基因的异同,最后采用PolySearch2挖掘慢阻肺易感基因相关的文献。结果:在RGD发现人类、小鼠、大鼠的慢阻肺易感基因数目最接近,3个物种在KEGG通路、生物表型、分子功能方面均有较大相似度。已发表文献中,关于慢阻肺易感基因Z分数>8.00的基因有14个。结论:人类、小鼠、大鼠在慢阻肺的相关疾病、涉及的信号通路及作用靶点等方面具有相似性,又有所差异。

关 键 词：慢性阻塞性肺疾病 易感基因 动物模型 比较基因组学 

分 类 号：R33[医药卫生—人体生理学]