沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析  

Bioinformatics analysis of LuxR family transcriptional regulator in Rhodopseudomonas palustris

作　　者：杨艳北 许晶 李袁飞 贡继尚 饶友生[1] Yang Yanbei

机构地区：[1]南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌330000 [2]南昌师范学院生物系,江西南昌330000

出　　处：《江苏农业科学》2021年第6期40-45,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：江西省教育厅科学技术研究项目(编号:GJJ181090、GJJ202631);南昌师范学院校级科研项目(编号:20RWYB02);南昌师范学院博士科研启动基金(编号:NSBSJJ2018023);国家自然科学基金(编号:31460595);南昌师范学院“11531”工程。

摘　　要：LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测,为后续研究生物被膜形成机制奠定基础,也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明:LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构,推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸,其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域,推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统,含有2个保守结构域,分别为Autoind_bind和HTH_LUXR,该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。

关 键 词：沼泽红假单胞菌 LUXR 生物信息学 生物被膜 

分 类 号：S188[农业科学—农业基础科学]