绵羊ATF3基因的生物信息学分析及其在营养剥夺应激下的表达变化  

作　　者：李俊玲 郭丽荣 郭田燕 秦健 杜荣[1] 

机构地区：[1]山西农业大学动物医学学院,山西太谷030801 [2]山西农业大学实验教学中心,山西太谷030801 [3]山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801

出　　处：《中国畜牧杂志》2021年第4期117-122,共6页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家自然科学基金(31872438);山西省重点研发计划项目(201803D221022-4);山西省留学回国人员科技活动择优资助项目;山西省平台基地和人才专项优秀人才科技创新项目(201605D211028);山西农业大学中青年拔尖创新人才支持计划(BJRC201204);山西农业大学横向科技项目(2015H X12)。

摘　　要：本研究旨在探究绵羊ATF3基因的蛋白特征、转录调控元件及其在营养剥夺应激下的表达变化。运用生物信息学相关软件对绵羊ATF3蛋白特征和ATF3基因启动子区元件进行分析预测,并在绵羊禁食3 d后检测骨骼肌中ATF3mRNA的表达量。结果显示,绵羊ATF3氨基酸数为187,分子式为C920H1521N273O282S12,等电点为8.89,不稳定系数是71.73,总平均疏水性值为-0.630;ATF3蛋白定位于细胞核,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,三级结构与二级结构保持一致且可信度高;进化树显示绵羊ATF3与牛、山羊、猪的同源性较高;qRT-PCR结果显示,与正常组相比,禁食组绵羊骨骼肌中ATF3mRNA表达量极显著降低;绵羊ATF3基因启动子区存在CREB、NFKB、AP1和GRE等与应激有关的转录因子结合元件,暗示了ATF3表达量下调的原因可能与这些元件和相应转录因子的结合有关。

关 键 词：绵羊 ATF3基因 生物信息学分析 营养应激 调控元件 

分 类 号：S826.2[农业科学—畜牧学]