水稻OsENOD93b基因组织表达模式与生物信息学分析  

Tissue expression pattern and bioinformatics analysis of OsENOD93b gene in rice

作　　者：何雨航 杜易桓 郭昊 赵頔 马银花 He Yuhang

机构地区：[1]湖南人文科技学院农业与生物技术学院/农田杂草防控技术与应用协同创新中心,湖南娄底417000

出　　处：《江苏农业科学》2021年第7期67-71,共5页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：湖南省自然科学基金(编号:2019JJ50281);湖南省教育厅项目(编号:18B455);国家级大学生创新创业训练计划平台项目(编号:201910553027X)。

摘　　要：主要探究OsENOD93b基因在水稻中的组织表达模式,并对其作生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR技术分析OsENOD93b基因的表达模式。用ExPASy-Protparam、Protscale、CDD、SOPMA、Phyre 2、Psort等在线工具对OsENOD93b进行生物信息学分析。经组织表达模式分析可知,OsENOD93b基因在叶片中的含量最多,其次是茎,含量最少的为根。通过ExPASy-Protparam分析发现,OsENOD93b分子量为16.42989 ku,是一种具有亲水性的不稳定的碱性蛋白。该蛋白属于ENOD93超级家族。通过SOPMA在线软件对OsENOD93b蛋白的二级结构进行分析预测,发现其由无规则卷曲(41.56%)、α-螺旋(39.61%)、延伸链区(14.94%)和β-转角(3.90%)4种形式组成。此外,利用不同在线工具对OsENOD93b蛋白的三级结构、保守区域、亚细胞定位进行生物信息学分析。结果表明,OsENOD93b基因在进化过程中具有一定的保守性,并有多样的潜在功能待研究。研究结果为进一步探明OsENOD93b基因的生物学功能提供了依据。

关 键 词：水稻 ENOD OsENOD93b 组织表达模式分析 生物信息学 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]