白来航鸡干扰素刺激基因12 PCR扩增  

作　　者：张淑萍 葛中东 张凯 夏宇欣 姜莉莉 樊兆斌 

机构地区：[1]菏泽市食品药品检验检测研究院,274000 [2]菏泽学院药学院,274715

出　　处：《中国畜禽种业》2021年第4期42-44,共3页The Chinese Livestock and Poultry Breeding

基　　金：山东省自然科学基金项目"β-半乳糖凝集素在禽网状内皮组织增生症病毒感染作用机制研究"(ZR2019MC036);菏泽学院培育基金项目"ATP1B1对禽网状内皮组织增生症病毒复制影响研究(XY18PY01)"。

摘　　要：本试验拟克隆白来航鸡干扰素刺激基因12(ISG12),并对其进行生物信息学预测分析。根据ncbi发表的原鸡ISG12基因序列(登录号:BN000223.1),设计ISG12基因特异性扩增引物。提取白来航鸡的肝脏、脾脏RNA,并反转录为cDNA,利用RT-PCR技术扩增白来航鸡ISG12基因序列,并利用生物软件对其编码蛋白进行生物信息学分析预测。结果显示,白来航鸡ISG12基因CDS区为324bp,编码107个氨基酸。ISG12编码蛋白理论分子量为10.28 kD,理论等电点(PI)为10.18,不稳定系数为59.46,脂肪系数为41.12。存在3个明显的亲水区,整条多肽链表现为亲水性;无信号肽,不存在跨膜区;存在21个潜在的磷酸化位点,6个潜在的O-糖基化位点,不含N-糖基化修饰位点;含有3个抗原决定簇区域。本试验成功克隆了白来航鸡ISG12基因,为深入了解ISG12编码蛋白的功能及进一步阐述其抗病毒的机理提供了科学依据。

关 键 词：ISG12基因 基因克隆 序列分析 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]