西藏大花红景天EST-SSR开发及通用性分析  

EST-SSR development and universal analysis of Tibet Rhodiola crenulata

作　　者：张力鹏[1] 滕彦娇 王宏鹏[1] 李天宇 宋文芹[1] 陈成彬[1] Zhang Lipeng

机构地区：[1]南开大学生命科学学院,天津300071

出　　处：《江苏农业科学》2021年第11期40-47,共8页Jiangsu Agricultural Sciences

摘　　要：以西藏大花红景天为研究对象,用MISA软件筛选转录组测序获得的48 790条unigene,开发EST-SSR(表达序列标签-微卫星序列)并对其通用性进行分析,以期为红景天属物种的遗传多样性研究和分子标记辅助育种奠定基础。结果表明,共检测出10 761个SSR位点,分布于8 973条unigene中,分布频率为22.06%,平均分布距离为4.725 kb。优势重复基序以单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸为主,其中单核苷酸重复单元以基序A/T为主,共7 167个,二核苷酸重复单元以AG/CT为主,共1 008个。随机合成280对引物,其中248对表现出有效扩增,54对具有多态性。此外,SSR引物在长鞭红景天、狭叶红景天、菊叶红景天、圣地红景天、柴胡红景天、高山红景天中具有较高的通用性,扩增效率分别为75.0%、73.75%、72.5%、62.5%、70.0%、72.5%。

关 键 词：大花红景天 转录组 SSR 通用性分析 

分 类 号：S567.239.01[农业科学—中草药栽培]