杧果SC-SSR分子标记反应体系的建立与优化  

Establishment and Optimization of SC-SSR Molecular Marker Reaction System for Mango

作　　者：覃昱茗 张宇[1] 黄国弟[1] 莫永龙[1] 罗世杏[1] 荣涛 QIN Yuming;ZHANG Yu;HUANG Guodi;MO Yonglong;LUO Shixing;RONG Tao(Guangxi Subtropical Crops Research Institute,Nanning,Guangxi 530001,China)

机构地区：[1]广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁530001

出　　处：《农业研究与应用》2021年第3期37-43,共7页Agricultural Research and Application

基　　金：国家重点研发计划项目(2019YFD1001103);广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂科农2021YT140);广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂农科2020YM53);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2020YM131);广西亚热带作物研究所基本科研业务费专项项目(桂热研201905)。

摘　　要：采用正交设计方法,对影响PCR反应体系的5个因素(Mg^(2+)、Taq DNA聚合酶、dNTPs、引物和模板DNA)进行了优化,建立了适用于杧果的SC-SSR-PCR反应体系。结果表明,总反应体系25μL中,包含模板DNA用量100 ng·mL^(-1)、Mg2+浓度2.00 mmol·L^(-1)、引物浓度0.40μmol·L^(-1)、Taq DNA聚合酶浓度1.00 U、dNTPs浓度0.15 mmol·L^(-1)。利用优化的杧果SC-SSR-PCR反应体系对10对SC-SSR引物进行验证,均能扩增出清晰、明亮、特异的电泳条带。因此,优化的杧果SC-SSR-PCR反应体系适用于杧果种质鉴定和亲缘关系分析。The orthogonal design method was used to optimize the five affecting factors(Mg^(2+),Taq DNA polymerse,dNTPs,primers and template DNA)on PCR reaction system,and the SC-SSR-PCR reaction system suitable for mango was established.The results showed that 25μL of the total reaction system contained 100 ng·mL^(-1) of template DNA,2.00 mmol·L^(-1) of Mg2+,0.40μmol·L^(-1) of primers,1.00 U of Taq DNA polymerase,and 0.15 mmol·L^(-1) of dNTPs.The optimized SC-SSR-PCR reaction system was used to verify 10 pairs of SC-SSR primers,and all of them could amplify clear,bright and specific electrophoretic bands.Therefore,the optimized SC-SSR-PCR reaction system is suitable for mango germplasm identification and genetic relationship analysis.

关 键 词：杧果SC-SSR 正交设计 体系优化 

分 类 号：S667.7[农业科学—果树学]