玉米细菌性枯萎病菌检测引物/探针的特异性评估  被引量:1

Validation on the specificity of PCR primers/probes for Pantoea stewartii subsp.stewartii

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作  者:魏霜 丁钿 于璇 黄法余 陈永青 李献锋 单长林 胡学难 Wei Shuang;Ding Tian;Yu Xuan;Huang Fayu;Chen Yongqing;Li Xianfeng;Shan Changlin;Hu Xuenan(Guangzhou Customs Technology Center,Guangzhou 510623;Guangzhou Baiyun Airport Customs Comprehensive Technical Service Center;Guangzhou Customs District;Zhoushan Customs Comprehensive Technical Service Center)

机构地区:[1]广州海关技术中心,广东广州510623 [2]广州白云机场海关综合技术服务中心 [3]广州海关 [4]舟山海关技术中心综合技术服务中心

出  处:《植物检疫》2021年第4期15-22,共8页Plant Quarantine

基  金:国家重点研发计划(2018YFC0809200);海关总署科技计划项目(2020HK147);广州海关科技计划项目(2020GZCK-004);浙江省基础公益研究计划(LGN18C140001)。

摘  要:利用6株玉米细菌性枯萎病菌(Pantoea stewartii subsp.stewartii,PSS)和29株相关菌株对报道的18对检测引物/探针的特异性进行测试。试验结果显示,其中16对引物/探针会出现假阳性或弱假阳性扩增,仅引物cpsAB2313F/cpsR和DC283galE/DC283galEc可以特异检测目的菌,两对引物的检测灵敏度分别为0.1 pg和1 pg。根据测试结果,推荐这2对引物用于检测玉米细菌性枯萎病菌,优先推荐引物cpsAB2313F/cpsR。6 strains of Pantoea stewartii subsp.stewartii and 29 strains of other related strains were collected,and 18 pairs of specific PCR primers/probes for the detection of P.stewartii subsp.stewartii were tested.The results showed that 16 pairs primers/probes had false positive amplification or weak false positive amplification.Only the cpsAB2313 F/cpsR and DC283 galE/DC283 galEc primers had good specificity with the detection sensitivity of 0.1 pg and 1 pg.Based on the above results,the cpsAB2313 F/cpsR and DC283 galE/DC283 galEc primers are recommended for the detection of P.stewartii subsp.stewartii,and the cpsAB2313 F/cpsR primers is better than the other.

关 键 词:玉米细菌性枯萎病菌 检测 引物 

分 类 号:S41[农业科学—植物保护]

 

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