3个伞形科植物CPP基因家族的比较基因组学分析  

作　　者：巩克 王希胤 

机构地区：[1]华北理工大学,河北唐山063210 [2]华北理工大学基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山063210

出　　处：《种子科技》2021年第16期11-13,16,共4页Seed Science & Technology

摘　　要：CPP基因家族是一个转录因子家族,具有多种生物学功能。通过利用比较基因组学的方法,对芹菜、香菜和胡萝卜3个伞形科的物种进行分析,并将结果与莴苣、葡萄和拟南芥的CPP基因家族进行比较。结果显示,在3个伞形科物种中共鉴定了26个基因,其中芹菜、香菜和胡萝卜中分别有8个、12个和6个;香菜中的同源基因数量远大于芹菜和胡萝卜;全基因复制在CPP基因家族的扩张中发挥了重要的作用。同时,通过RNA-seq分析了不同组织中CPP基因的表达,将为伞形科中CPP和其他基因家族的比较和功能分析提供参考。

关 键 词：伞形科 基因家族 CPP-like 

分 类 号：Q943.2[生物学—植物学]