尼瓦拉野生稻FKBP基因家族的鉴定及功能分析  

作　　者：李玉峰 黄训文 卢凤梅 黄彦森 孔宇 

机构地区：[1]百色学院农业与食品工程学院,广西百色533000

出　　处：《现代化农业》2021年第10期29-33,共5页Modernizing Agriculture

基　　金：2020年度广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2020KY19024)。

摘　　要：用HMMER软件,根据FKBP蛋白特征保守结构域初步鉴定了FKBP家族蛋白,再对初步鉴定的FKBP家族蛋白序列进行Pfam数据库保守结构域搜索,进一步甄别确定。据此得到尼瓦拉野生稻FKBP基因25个,转录本40个;亚洲栽培稻FKBP基因26个,转录本33个。根据尼瓦拉野生稻和亚洲栽培稻FKBP蛋白的系统进化关系和相关注释信息对尼瓦拉野生稻FKBP基因家族成员进行了命名,并用在线软件对比分析了尼瓦拉野生稻和亚洲栽培稻FKBP家族蛋白理化性质、转录本结构和蛋白保守基序,初步讨论了尼瓦拉野生稻与对应的亚洲栽培稻FKBP家族成员间的异同点,并结合NCBI的SRA数据库中相关RNA测序数据分析FKBP基因在不同生长时期和不同器官内的表达情况,为相关研究提供有益参考。

关 键 词：尼瓦拉野生稻 FKBP 基因家族 转录本结构 蛋白保守基序 

分 类 号：S511.9[农业科学—作物学]