不同基因型鹅星状病毒鉴别诊断RT-PCR方法的建立  

Development of an RT-PCR method for identification of two genotypes of goose astrovirus

作　　者：王宏宇 朱寅初[1] 云涛 华炯钢[1] 叶伟成[1] 倪征[1] 陈柳[1] 张存[1] WANG Hongyu

机构地区：[1]浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,浙江杭州310021 [2]南京农业大学动物医学院,江苏南京210095

出　　处：《浙江农业科学》2021年第11期2299-2302,2309,共5页Journal of Zhejiang Agricultural Sciences

基　　金：浙江省重点研发计划(2019C02052);浙江农业科学院2020年度青年人才培养项目(10102000320CC300G/003/020)。

摘　　要：鹅星状病毒(GAstV)是近年临床新发病原,也是导致当前雏鹅痛风致死的主要病因,研究显示该病毒存在两种不同基因型。为建立快速准确的核酸鉴别诊断方法,本研究针对不同基因型GAstV保守域RNA依赖性RNA聚合酶序列各设计1对特异性引物,建立以RNA为模板的双重一步法RT-PCR检测方法。条件优化试验结果显示,双重RT-PCR方法彼此无干扰;引物特异性强,对坦布苏病毒、鹅细小病毒、呼肠孤病毒、鸭瘟病毒的检测均为阴性;体系中引物适宜浓度为1μmol,退火温度范围广,50~54℃皆可;敏感性高,最低检测限分别为103拷贝数和102拷贝数。对采集自江浙地区的73份样品进行检测,结果显示,鹅星状病毒阳性率为93.2%,主要为Ⅱ型星状病毒的单一感染(阳性率86.3%),部分样品呈现两种类型星状病毒混合感染现象(阳性率6.8%)。上述结果表明本研究建立的双重RT-PCR方法可用于GAstV的鉴别诊断和分子流行病学调查。

关 键 词：鹅星状病毒 一步法RT-PCR 基因型 检测方法 

分 类 号：S858.32[农业科学—临床兽医学]