玉米抗感粗缩病重要miRNA及其靶基因的诠释  

Interpretation of important miRNAs and target genes for maize resistance and susceptibility to rough dwarf disease

作　　者：吴斌[1] 崔汉青 张眉[1] 邵春国 姜珊珊[1] 郭霞[1] 徐德坤 王升吉[1] Wu Bin

机构地区：[1]山东省农业科学院植物保护研究所/山东省植物病毒学重点实验室,山东济南250100 [2]山东省平度市职业中等专业学校,山东平度266752 [3]山东省临沂市农业技术推广服务中心,山东临沂276000

出　　处：《江苏农业科学》2021年第20期64-69,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：山东省重点研发计划(编号:2018GSF121029);国家重点研发计划(编号:2018YFD0200603);山东省农业科学院农业科学创新工程(编号:CXGC2016B11-绿色防控)。

摘　　要：借助高通量测序和生物学分析手段,筛选不同抗性品种间的差异表达miRNA,预测相关靶基因。对玉米抗、感粗缩病不同种质材料高通量测序鉴定出的差异miRNA的靶基因,在Genome、Gene Ontology等生物信息数据库中进行比对,同时做GO(Gene Ontology,简称GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes,简称KEGG)富集性分析。从某些相关差异miRNA的靶基因及其作用位点的有关GOID及其生物学功能注释中,发现一些可能与玉米粗缩病抗性有较大关系的miRNA,如zma-miR156a、zma-miR156k、zma-miR1432等;通过进一步的miRNA靶基因KEGG富集性分析,获得代谢通路ID,根据其生物功能注释,推测也有一定数量的miRNA与玉米种质抗(感)病相关。结合所涉差异miRNA在玉米抗、感种质接毒前后上、下调的表现,对这些重要miRNA靶基因可能涉及粗缩病的致病机制或玉米抗性相关的GOID、KEGG通路ID所蕴含的功能进行了诠释。研究旨在探明抗病相关miRNA通过靶向作用其靶基因,在抗病过程中可能发挥的重要生物学功能和作用途径,研究结果可为探讨玉米抗粗缩病的抗病机制研究奠定理论基础。

关 键 词：玉米粗缩病 差异miRNA 高通量测序 靶基因 富集分析 

分 类 号：S435.13[农业科学—农业昆虫与害虫防治]