柴胡属植物ITS2序列鉴定与核型似近系数聚类分析  

作　　者：张鑫瑞 宋芸[1] 李政 孙哲 李澳旋 乔永刚[1] 

机构地区：[1]山西农业大学生命科学学院,山西太谷030801

出　　处：《时珍国医国药》2021年第10期2425-2431,共7页Lishizhen Medicine and Materia Medica Research

基　　金：国家重点研发计划(2019YFC1710801)。

摘　　要：目的基于ITS2条形码鉴定柴胡属植物及其易混品,对染色体核型参数进行似近系数聚类分析,为柴胡属植物的亲缘关系判定、种质鉴定及物种进化提供依据。方法收集75份柴胡材料以及在GeneBank数据库中下载29条核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2)序列。提取柴胡基因组DNA,对其ITS2序列进行PCR扩增并且双向测序,所得序列用CodonCode Aligner软件校对拼接后,利用MEGA X对序列进行分析比对,计算种内、种间遗传距离。利用邻接法(NJ)构建系统聚类树,并应用ITS2数据库网站预测其ITS2二级结构,利用4Sale1.7.1对共有二级结构进行分析;统计整理13种柴胡属植物的核型数据,进行似近系数聚类分析,并计算核型似近系数及遗传距离。结果 75份柴胡材料中,有67条被鉴定为北柴胡,3条被鉴定为黑柴胡,2条被鉴定为藏柴胡,2条被鉴定为三岛柴胡,1条被鉴定为狭叶柴胡。北柴胡的种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离,NJ树北柴胡单独聚为一类,具有良好的单系性,ITS2二级结构与NJ树结合可以很好地鉴定柴胡属植物及其混伪品。当核型似近系数接近0.7151时,13种柴胡属植物可以聚类为3大类群。13种柴胡属植物中,线叶柴胡与紫花大叶柴胡核型似近系数最大(0.9955),进化距离最小(0.0045),长白柴胡与锥叶柴胡的核型似近系数最小(0.1476),其进化距离最大(1.9135)。结论基于ITS2条形码技术可以对柴胡属植物进行鉴定,研究柴胡属植物核型似近系数及遗传进化距离,为确保柴胡用药安全,准确鉴定柴胡属植物,规范柴胡人工栽培,以及柴胡属植物的亲缘关系判定等方面提供科学依据。

关 键 词：柴胡 核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2) 核型 进化距离 

分 类 号：R282.12[医药卫生—中药学]