乳中不同体细胞数的新疆褐牛STAT5B基因表达及生物信息学分析  

作　　者：刘攀 姜徽 巨星 王丹[1] 田月珍[2] 付雪峰[2] 李媛媛 苟穆荣 王震 樊琛 布佐拉姑丽·库尔班 黄锡霞[1] 

机构地区：[1]新疆农业大学动物科学学院,新疆乌鲁木齐830052 [2]新疆畜牧科学院,新疆乌鲁木齐830000

出　　处：《中国畜牧杂志》2022年第2期106-112,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：国家自然科学基金项目(31860630);新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2020D01A52);自治区科技援疆计划项目(2018E02052);国家级大学生创新创业训练计划项目(201910758003)。

摘　　要：新疆褐牛是我国育成的首个乳肉兼用牛品种,具有抗逆性强、体细胞数低、耐粗饲的优点,拥有西北第一牛的美称。前人研究发现,STAT5B基因与新疆褐牛的泌乳性状有关,为了进一步探索STAT5B基因对新疆褐牛泌乳性状的影响,通过采用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对STAT5B基因在不同乳房健康程度的新疆褐牛血液中的相对表达量进行分析;同时使用NCBI Blast、ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODE、MEGA、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0 Server、WoLF PSORT等生物信息学分析软件对STAT5B基因编码的蛋白进行结构分析与功能预测。RT-qPCR结果表明:STAT5B基因对奶牛乳房炎影响不显著,但STAT5B基因在健康新疆褐牛血液中的表达量高于患乳房炎的新疆褐牛。生物信息学分析结果表明:STAT5B基因编码蛋白的分子式为C_(4006)H_(6263)N_(1111)O_(1197)S_(25),共编码787个氨基酸;进化树分析结果表明牛STAT5B基因与水牛的亲缘关系较为接近;经预测STAT5B基因编码的蛋白质是一种亲水性蛋白,主要由亮氨酸组成;该蛋白中α-螺旋高达50.95%,β-折叠的含量最少。该分析及预测结果主要为探索新疆褐牛STAT5B基因的功能奠定基础,为阐明其对新疆褐牛泌乳性状的影响提供了理论依据。

关 键 词：新疆褐牛 STAT5B RT-QPCR 生物信息学分析 体细胞数 

分 类 号：S823.2[农业科学—畜牧学]