山羊原癌基因c-fos电子克隆与生物信息学分析  

In silico cloning and bioinformatics analysis of Capra hircus c-fos gene

作　　者：宋兴超 赵园园 孟金柱 吴震洋 安清明 Song Xingchao

机构地区：[1]铜仁学院农林工程与规划学院/贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州铜仁554300

出　　处：《江苏农业科学》2022年第3期68-73,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：贵州省铜仁市科学技术局博士人才项目[编号:铜市科研(2020)126号];铜仁学院博士科研启动基金(编号:trxyDH2001);贵州省科技计划(编号:黔科合支撑2020-1Y029);贵州省普通高等学校科技拔尖人才支持计划(编号:黔教合KY字2017-089);贵州省铜仁市科技计划(编号:2020-75)。

摘　　要：为探明山羊原癌基因c-fos的结构与功能,以牛c-fos基因编码序列(GenBank登录号为AY322482)作为种子序列电子克隆了山羊c-fos基因cDNA序列,并利用生物信息学方法对其完整编码序列的蛋白理化特征、二级结构、亲/疏水性进行全面解析,进一步预测了该基因在山羊染色体上的定位。结果表明,山羊c-fos基因cDNA全长1 513 bp,开放阅读框为1 143 bp,共编码380个氨基酸,G+C含量高于A+T;山羊c-fos基因编码蛋白二级结构主要以无规则卷曲为主,其他为α-螺旋,延伸直链较少,属于一种亲水性、酸性不稳定蛋白;山羊与同属反刍动物的绵羊、牛和马鹿c-fos基因核苷酸序列相似性为95.4%~99.5%;c-fos基因可能定位于山羊10号染色体上。山羊c-fos基因电子克隆及序列分析为解析其调控肌肉发育的生理功能提供了详尽的生物学基础信息。

关 键 词：原癌基因 山羊 染色体 生物信息学分析 肌肉发育 

分 类 号：S827[农业科学—畜牧学]