龙眼SNP高密度遗传图谱的构建及单果质量QTL定位  被引量:2

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作  者:张晨晨 王佳卉 刘丽琴[2] 王一承[2] 周建男 胡小文 石胜友[2] 

机构地区:[1]华中农业大学园艺林学学院,武汉430070 [2]中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室,广东湛江524091

出  处:《中国南方果树》2022年第2期89-96,共8页South China Fruits

基  金:广东省重点领域研发计划“现代种业”(2020B020220006);广东省自然科学基金(2020A1515011365);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-32-02);中国热带农业科学院基本科研业务费(1630062020003)资助。

摘  要:以“凤梨朵”ד大乌圆”的杂交后代F_(1)200株(FD群体)作为作图群体,结合父母本,利用RAD-seq技术开发SNP标记,采用Joinmap 4.1软件构建遗传图谱,使用Mergemap进行整合;并采用MapQTL软件对单果质量进行QTL定位,确定QTL位点的数量、位置。结果表明,使用MergeMap软件对父母本连锁群进行整合,整合图谱共形成15个连锁群,总的遗传距离为2873.39 cM,平均遗传距离为0.36 cM,包含8014个SNP位点。在该图谱上监测到65个与单果质量性状相关的QTL位点,分布于lg1、lg3、lg4、lg5、lg8、lg10、lg14连锁群上。本研究所构建的遗传图谱是目前龙眼上所建立的标记数量最多,密度最高的遗传图谱,为未来龙眼数量性状精细定位、图位克隆以及功能基因挖掘等研究提供了有力的依据。

关 键 词:龙眼 高密度遗传图谱 高通量测序 QTL定位 连锁群 

分 类 号:S667.2[农业科学—果树学]

 

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