兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因生物信息学分析  

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作  者:岳丹 席冬梅[1] 刘兴能 任洪辉 陆颖 张雪[1] 何志辉 邓卫东[1] 

机构地区:[1]云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201 [2]四川省甘孜州畜牧业科学研究所,四川甘孜藏族自治州626000

出  处:《中国畜牧杂志》2022年第3期92-98,共7页Chinese Journal of Animal Science

基  金:国家自然科学基金项目(32160771);国家重点研发计划(2018YFD0502100-5)。

摘  要:根据NCBI收录的绵羊SLC17A8(Solute Carrier Family 17 Member 8)基因序列设计特异性引物,利用PCR技术扩增兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因外显子区,经测序后拼接序列,并对编码区序列以及翻译后蛋白序列进行蛋白结构预测。结果显示,兰坪乌骨绵羊SLC17A8基因编码区长为1770 bp,编码589个氨基酸。同源性比对显示兰坪乌骨绵羊SLC17A8氨基酸序列与普通绵羊的该基因氨基酸序列同源性达到99.66%,发现有11个突变位点,其中2个错义突变位点,SLC17A8-Exon1 G159A位点编码的氨基酸由Gly(甘氨酸)突变到Glu(谷氨酸);SLC17A8-Exon2 G87A位点编码的氨基酸由Gly突变到Arg(精氨酸)。蛋白结构预测显示,SLC17A8蛋白空间结构主要有α螺旋、β转角和无规则卷曲。

关 键 词:兰坪乌骨绵羊 SLC17A8基因 PCR扩增 生物信息学 

分 类 号:S826.2[农业科学—畜牧学]

 

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