一株重组犬冠状病毒的鉴定及3'端分子特征分析  

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作  者:蔡冬冬[1] 李建岗 范毅 罗毅[1] 崔鹏博 胡晓亮 田志革 

机构地区:[1]四川省动物疫病预防控制中心,四川成都610041 [2]四川省成都市动物疫病预防控制中心,四川成都610041 [3]宜宾学院农林与食品工程学部,动物多样性与生态保育宜宾市重点实验室,四川宜宾644000 [4]成都海关,四川成都610041

出  处:《四川畜牧兽医》2022年第4期26-29,共4页Sichuan Animal & Veterinary Sciences

基  金:四川省科技计划项目“卫生与动植物检疫措施对四川农业出口贸易的影响研究”(2021JDR0129);宜宾学院博士启动项目(2019QD09,2019QD10)。

摘  要:为了解犬冠状病毒(CCoV)的基因组特征和遗传变异情况,本试验利用RT-PCR方法从患病犬肠道内容物中鉴定出一株CCoV,命名为BM35。通过RT-PCR方法扩增S、E、M、N和ORF7基因,然后对测序结果拼接并进行系统进化树和遗传重组分析。结果显示:BM35的3'端序列长度为8 870 bp;遗传进化树分析发现BM35与浙江株B639/ZJ/2019、台湾株NTU336、日本株FC1和越南株HCM47处于同一独立分支;重组分析发现BM35与台湾株NTU156和越南株HCM47在S基因发生重组。本研究有助于深入了解国内CCoV流行毒株的分子特性,为后续CCoV诊断试剂和疫苗的开发提供依据。

关 键 词:犬冠状病毒 S基因 重组 分子特征 

分 类 号:S852.655[农业科学—基础兽医学]

 

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