枣瘿蚊图尔病毒(DjTV-2a)衣壳蛋白生物信息学分析及抗原表位预测  

Bioinformatics analysis and epitopes prediction of capsid protein of jujube gall midge tour virus (DjTV-2a)

作　　者：张来斌 马光皇 刘语涵 贺鹏鹏 肖海兵[1,2] 杨明禄 Zhang Laibin

机构地区：[1]塔里木大学农学院,新疆阿拉尔843300 [2]南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室,新疆阿拉尔843300

出　　处：《江苏农业科学》2022年第9期33-36,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：新疆生产建设兵团财政科技计划(编号:2020DA003、2019DA001);塔里木大学研究生科研创新项目(编号:TDGRI202019)。

摘　　要：分析枣瘿蚊图尔病毒(DjTV-2a)衣壳蛋白的理化性质、蛋白结构及抗原表位。从UniProt数据库中得到DjTV-2a衣壳蛋白的氨基酸序列,利用Expasy、TMHMM、DNAStar、SignalP 5.0、TMHMM、NetPhos 3.1、NET CGlyc 1.0、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学软件,预测DjTV-2a衣壳蛋白的理化性质、氨基酸组成、亲疏水性、信号肽、跨膜结构、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构和抗原表位等。结果表明,DjTV-2a衣壳蛋白是由449个氨基酸构成的亲水蛋白,分子式为C_(2337)H_(3607)N_(601)O_(689)S_(15),分子量为51.6 ku,理论等电点为5.98;主要二级结构是无规则卷曲,存在82个磷酸化位点和1个糖基化位点,无信号肽和跨膜结构;该蛋白有21个B细胞优势抗原表位和10个T细胞优势抗原表位。DjTV-2a衣壳蛋白属亲水蛋白,具有多个抗原表位,预测其具有免疫原性,是可用作建立血清学检测技术的潜在抗原。

关 键 词：枣瘿蚊 图尔病毒 衣壳蛋白 生物信息学 抗原表位 

分 类 号：S433.89[农业科学—农业昆虫与害虫防治] S186[农业科学—植物保护]