基于转录组的糙苏MYB转录因子的挖掘及分析  

Mining and analysis of MYB transcription factors based on transcriptome of Phlomis umbrosa

作　　者：熊勇 赵春艳[2] 李晓艳 XIONG Yong

机构地区：[1]云南民族大学民族医药学院,云南昆明650500 [2]中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明650221

出　　处：《浙江农业科学》2022年第8期1689-1698,共10页Journal of Zhejiang Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金(81760655);云南民族大学民族药资源化学国家民委—教育部重点实验室开放课题基金(MZY2104)。

摘　　要：本研究基于糙苏的转录组数据库,挖掘参与糙苏生长发育及次生代谢产物合成相关的MYB转录因子,对糙苏MYB转录因子的理化性质、氨基酸序列及保守基序、高级结构、系统进化树进行挖掘和生物信息学分析,并结合GO注释、蛋白质功能预测和表达模式进行深入分析。从糙苏转录组数据中共挖掘出61条具有完整MYB保守结构域的转录因子序列;系统进化分析结果显示,糙苏MYB转录因子可能参与糙苏黄酮类物质的生物合成,在生长发育过程及抗逆性胁迫中起作用;GO注释分析表明,糙苏MYB转录因子家族蛋白在生物学过程中主要参与糙苏的细胞过程和生物调节过程;PuMYB7、PuMYB10、PuMYB34、PuMYB40、PuMYB42、PuMYB43参与了植物萜类代谢生物途径;表达分析显示,PuMYB48、PuMYB51、PuMYB9、PuMYB17、PuMYB56可能参与糙苏根部木质素的生物合成和次生生长等过程。

关 键 词：糙苏 转录组 MYB转录因子 

分 类 号：S567[农业科学—中草药栽培]