基于生信分析Hp相关性胃炎核心基因及其靶向中药筛选  

作　　者：王杰[1] 柳亚杰 刘丽然 杜朋丽 杨倩[2] 郭子敬 

机构地区：[1]河北中医学院,河北石家庄050091 [2]河北中医学院第一附属医院,河北石家庄050000

出　　处：《时珍国医国药》2022年第6期1524-1527,共4页Lishizhen Medicine and Materia Medica Research

基　　金：国家中医临床研究基地建设项目(国中医药办科技函[2018]18号);国家科技部重点研发课题(2018YFC1704100,2018YFC1704102);河北省省级科技计划资助(21377724D,21377740D);河北省中医药管理局科研计划项目(2021034)。

摘　　要：目的基于生物信息学方法初步分析Hp相关性胃炎和非Hp相关性胃炎胃组织的差异表达基因并探索发病机制,进而预测潜在靶向治疗Hp相关性胃炎的中药。方法从GEO数据库中选取数据集GSE5081,借用R语言分析得出差异表达基因(DEGs),应用DAVID数据库对DEGs进行GO功能注释及KEGG信号通路富集分析,采用STRING数据库构建DEGs蛋白质相互作用网络(PPI),利用Cytoscape获取核心基因,最后通过Coremine Medical挖掘靶向作用于核心基因的中药。结果该研究共获得DEGs 85个,其中56个上调基因,29个下调基因。DEGs主要涉及免疫反应、趋化因子介导的信号通路、中性粒细胞趋化性的正向调节、炎症反应、对脂多糖的反应等生物学过程;主要富集在趋化因子信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路上。蛋白互作网络及Cytoscape筛选出CXCL1、CXCL3、CXCL5、CXCL13、CCL19、CCL20、CCL25、CCR7、PNOC、GPR18、GPR183、CXCR2等12个核心基因。进一步分析获得可能用于治疗Hp相关性胃炎潜在中药,归纳为清热解毒类:黄芩、黄连、生地、茵陈、大青叶等;活血化瘀类:川芎、没药等;理气类:木香、檀香等药物。结论该研究利用生物信息学筛选出Hp相关性胃炎DEGs并预测潜在治疗中药,探讨Hp相关性胃炎发生发展中潜在机制,为临床和科研提供依据。

关 键 词：HP相关性胃炎 差异表达基因 靶向中药 

分 类 号：R2-03[医药卫生—中医学]