基于SNP芯片挖掘伍隍猪新遗传材料  被引量:9

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作  者:杨祎挺 甘麦邻 刘杨 辜浩 沈林園[1] 朱砺[1] 

机构地区:[1]四川农业大学动物科技学院,四川成都611130

出  处:《中国畜牧杂志》2022年第8期178-188,共11页Chinese Journal of Animal Science

基  金:四川省科技计划资助(2021YFYZ0007,2021ZDZX0008,2020YFN0147);国家现代农业产业技术体系四川生猪创新团队(scsztd-2022-08-09)。

摘  要:为进一步了解伍隍猪与内江猪在群体结构、基因组信息、遗传进化上的差异,本研究主要利用50K SNP基因芯片,分别对131头伍隍猪个体和156头内江猪个体进行基因分型。结果表明:2个品种群体间的亲缘关系相对较远但存在一定的遗传联系。伍隍猪保种群的多态性标记比例(0.6419)大于内江猪保种群(0.5060);且伍隍猪的LD衰减速度大于内江猪;群体有效含量分析表明2个品种在219世代内相对缩减了96.68%;进化树显示出伍隍猪、内江猪与四川其他猪种分离,但在2个群体内部有明显区分;ROH鉴定与选择信号分析发现伍隍猪在繁殖性能与耐受性等方面受到了正向选择。该结论为伍隍猪种质资源开发、利用提供了重要理论依据。

关 键 词:伍隍猪 内江猪 SNP芯片 种质资源鉴定 群体遗传结构 

分 类 号:S828.2[农业科学—畜牧学]

 

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