郏县红牛Y染色体基因组遗传多样性与父系起源研究  

作　　者：常振华[1] 王世康 亐开兴 夏小婷 黄永震[2] 雷初朝[2] 

机构地区：[1]渭南职业技术学院,陕西渭南714026 [2]西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100 [3]楚雄师范学院,云南楚雄675000

出　　处：《中国畜牧杂志》2022年第10期175-178,共4页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：渭南职业技术学院2019年度院级科研立项课题(WZ YY201906);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-37);楚雄师范学院博士科研启动项目(BSQD2101)。

摘　　要：本研究旨在从基因组水平研究郏县红牛Y染色体遗传多样性与父系血统来源,为郏县红牛品种遗传资源的保护与利用提供科学依据。利用全基因组重测序数据,对16头郏县红牛Y染色体基因组X-退化区单拷贝基因区进行扫描和分析,共覆盖到Y染色体上7个单拷贝基因。使用发表的5头黄牛Y染色体基因组单倍型作对照,构建郏县红牛Y染色体单倍型最大似然法(ML)系统进化树及网络图,结果表明:16头郏县红牛在Y染色体X-退化区单拷贝基因区域中共发现有178个位点具有多态性,涵盖7个Y染色体单拷贝基因;并定义了5种郏县红牛Y染色体单倍型,分别将其命名为JXR1~5,其中JXR4为优势单倍型,占50.0%;郏县红牛Y染色体单倍型多样度为0.717±0.095,核苷酸多样度为0.0618±0.0198;系统发育树和单倍型网络图表明,郏县红牛有Y2a、Y2b和Y3a 3种亚单倍型组,其中Y2b为主要亚单倍型组。本研究从Y染色体基因组水平证实郏县红牛有Y2和Y32个父系起源。

关 键 词：郏县红牛 Y染色体基因组 单倍型 父系起源 

分 类 号：S823.2[农业科学—畜牧学]