基于网络药理学和分子对接的藏药“甘松-余甘子”治疗幽门螺杆菌相关胃炎的机制探究  

作　　者：杨帅 王月 李根 张亮亮 李楠 张会存[5] 伊比然恨 汪红兵 

机构地区：[1]首都医科大学附属北京中医医院消化科,北京100010 [2]拉萨市人民医院,西藏拉萨850000 [3]北京中医药大学研究生院 [4]首都医科大学附属北京中医医院 [5]北京中医研究所,北京100010

出　　处：《西藏科技》2022年第11期74-80,共7页Xizang Science And Technology

基　　金：国家自然科学基金资助项目“基于高通量小RNA测序研究健脾清化汤通过调节iNOS与mir-21治疗慢性萎缩性胃炎异型增生的机制研究”(8177150984);西藏自治区自然科学基金组团式医学援藏项目“高原地区Hp感染相关胃炎患者中医体质及‘病-症-证’分类研究”〔XZ2022ZR-ZY23(Z)〕。

摘　　要：目的文章基于网络药理学和分子对接的方法,探究藏药“甘松-余甘子”治疗幽门螺杆菌相关胃炎的相关作用机制。方法运用TCMSP,获得藏药“甘松-余甘子”活性成分及相关的作用靶点,应用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获得幽门螺杆菌相关胃炎相关靶点,绘制韦恩图获取药物疾病共同靶点,将其输入Cytoscape 3.7.2软件绘制“药物-成分-疾病-靶点”网络。运用R语言及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白相互作用PPI网络。通过R语言对靶点基因进行GO、KEGG集分析。分别采用AutoDock软件、Pymol软件进行分子对接、可视化验证。结果藏药“甘松-余甘子”通过15个有效成分作用于16个幽门螺杆菌相关胃炎治疗靶点。筛选出4种核心有效成分,4个核心靶点包括PTGS2、TNF、CASP3、TP53。GO富集分析主要涉及神经元死亡调节、神经元死亡、电离辐射响应、糖皮质激素反应、对紫外线的反应、内在的凋亡信号通路、皮质类固醇反应等生物过程进行调节,KEGG富集分析主要涉及P53信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路。4种核心有效成分与主要核心靶点PTGS2、TNF、CASP3、TP53均具有一定的结合活性。结论藏药“甘松-余甘子”治疗幽门螺杆菌相关胃炎的机制,可能是通过“多成分-多靶点-多通路”,发挥抗炎、抗癌、抗氧化、抗凋亡、促进血管生成的作用。

关 键 词：甘松 余甘子 幽门螺杆菌相关胃炎 网络药理学 作用机制 分子对接 

分 类 号：R285[医药卫生—中药学]