蛋鸡资源群体的小肠质量全基因组关联分析  

Genome-wide association analysis for small intestine weight of laying hens

作　　者：李永峰 王克华[1] 窦套存[1] 胡玉萍[1] 郭军[1] 王星果[1] 马猛[1] 曲亮[1] Li Yongfeng

机构地区：[1]江苏省家禽科学研究所,江苏扬州225125

出　　处：《江苏农业科学》2022年第22期165-170,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：江苏省种业振业揭榜挂帅项目(编号:JBGS[2021]104);江苏省农业重大新品种创制(编号:PZCZ201729);现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-40-K01)。

摘　　要：小肠是鸡重要的营养消化吸收器官,在蛋鸡生长和生产发挥重要作用,小肠质量是反映肠道发育情况的重要生理指标,有必要对其遗传结构进行研究。利用白来航鸡与东乡绿壳蛋鸡杂交构建F_(2)代资源群体,采用600K鸡SNP芯片对F_(2)代1512羽个体进行基因型检测,通过PLINK软件对小肠质量性状进行全基因组关联分析(GWAS)。结果显示,十二指肠、空肠和回肠的遗传力分别为0.32、0.28、0.26,说明小肠质量表现出中等遗传力水平。GWAS共鉴定出185、201、36个SNP分别与十二指肠、空肠、回肠质量显著相关(共422个SNP),其中,421个SPN位于1号染色体166.6~173.2 Mb区域,说明该区域与小肠质量关系密切。共有28个SNP与3段小肠质量均显著相关,其中,6个SNP位于对应4个候选基因(FOXO1、CKAP2、CAB39L和MRPS31)的内含子区,它们可能与小肠质量密切相关。通过GWAS分析,初步筛选出与蛋鸡小肠质量性状相关的6个SNP和4个候选基因,可为性状的遗传机制解析和分子育种提供理论依据。

关 键 词：蛋鸡 小肠质量 GWAS 遗传结构 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]