基于NCBI核酸数据库的田头菇属Agrocybe真菌系统发育探析  

作　　者：王龙 周庆平[2] 李伶俐 石国华[2] 

机构地区：[1]中国科普研究所,北京10081 [2]唐山师范学院,河北唐山063000

出　　处：《科技视界》2022年第25期5-8,共4页Science & Technology Vision

基　　金：河北省高等学校科学技术研究资助项目(ZD2020403);唐山市科技计划农业发展项目(19150203E);唐山师范学院博士基金(2020A13)。

摘　　要：物种的系统发育研究是有效保护和开发利用其种质资源的基础学科。为了明确我国及世界范围内田头菇属Agrocybe属一级水平的遗传发育关系,文章基于美国国立生物信息中心核酸数据库,以单基因ITS序列为研究对象,采用T92(Tamura 3-paramete)参数模型计算遗传距离,并应用邻接法构建田头菇属Agrocybe属一级水平的系统发育树。结果表明,NCBI核酸数据库中田头菇属Agrocybe 43个物种(含已知物种31个和待定物种12个)的192条ITS单基因序列构建的系统发育树大致分为6个分支,归属于不同组别,并对其中的17条待定物种信息进行了初步分子鉴定。

关 键 词：NCBI核酸数据库 ITS序列 田头菇属 系统发育 

分 类 号：TP3[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]