基于多重解码器的自编码器模型的生物序列聚类方法  被引量:2

Biological Sequence Clustering Method Based on Multi-decoder Autoencoder Model

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作  者:陈城 林劼[1] CHEN Cheng;LIN Jie(School of Mathematics and Statistics,Fujian Normal University,Fuzhou 350117,China)

机构地区:[1]福建师范大学数学与统计学院,福建福州350117

出  处:《福建师范大学学报(自然科学版)》2022年第6期1-9,共9页Journal of Fujian Normal University:Natural Science Edition

基  金:国家自然科学基金资助项目(61472082)。

摘  要:提出一种基于多重解码器的自编码器模型,用于学习生物序列数据的表示,并使用k-means算法对序列的表示进行聚类.试验结果验证了提出的方法在DNA序列数据集上具有良好的性能.In this paper, an autoencoder model based on multi-decoder is proposed to learn the representation of biological sequence data, and thenk-means is used to cluster the representation of sequences.Experimental results show that the proposed method has good performance on DNA sequence data sets.

关 键 词:生物序列聚类 自编码器 表示学习 

分 类 号:Q811.4[生物学—生物工程]

 

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