2020年猪圆环病毒2型云南流行株的分子鉴定及全基因组序列分析  

作　　者：周玉照 张小苗 柴俊 

机构地区：[1]大理农林职业技术学院,云南大理671003 [2]云南农业大学动物医学院,云南昆明

出　　处：《山东畜牧兽医》2023年第1期12-16,21,共6页Shandong Journal of Animal Science and Veterinary Medicine

摘　　要：为了弄清云南省猪圆环病毒2型(PCV-2)的流行和基因变异情况,试验采用PCR鉴定、PCV-2全基因扩增及克隆、PCV-2蛋白氨基酸比对与遗传进化分析、PCV-2 Cap蛋白氨基酸比对分析、PCV-2 Cap蛋白抗原指数预测分析等方法进行研究。结果表明,从43份样品中检测出5份阳性样品,其阳性率为11.63%;成功获得5个大小为1768 bp的PCV-2全基因序列,分别将其命名为YN PCV2-1、YN PCV2-2、YN PCV2-3、YN PCV2-4、YN PCV2-5;获得的5株毒株与国内外毒株氨基酸之间存在差异,同源性在66.8%~99.1%之间;5株PCV-2 ORF2基因编码的Cap蛋白氨基酸与5株疫苗株也存在多处氨基酸变异;其中YN PCV2-4 Cap蛋白抗原指数与5株疫苗株的Cap蛋白抗原指数差异性不大,而YN PCV2-1、YN PCV2-2、YN PCV2-3、YN PCV2-5的Cap蛋白抗原指数与5株疫苗株的Cap蛋白抗原指数差异性较大,在5~10,25,40~50,70,172~176,210~223区域的抗原指数均不同于疫苗株。说明云南省流行的猪圆环病毒2型已发生变异。

关 键 词：PCV-2 分子鉴定 同源性分析 遗传进化分析 抗原指数 

分 类 号：S852.6592[农业科学—基础兽医学]