藜麦黄素单加氧酶基因(CqYUCCA)家族的全基因组鉴定与分析  

Genome-Wide Identification and Analysis of Flavin Monooxygenase Gene(CqYUCCA)Family in Quinoa(Chenopodium quinoa Willd.)

作　　者：褚晶 田晓芹 陈世华[1] 郭善利[1] CHU Jing;TIAN Xiao-qin;CHEN Shi-hua;GUO Shan-li(School of Life Sciences,Yantai University,Yantai 264005,China)

机构地区：[1]烟台大学生命科学学院,山东烟台264005

出　　处：《烟台大学学报（自然科学与工程版）》2023年第1期20-27,共8页Journal of Yantai University(Natural Science and Engineering Edition)

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31370296);山东省“渤海粮仓”科技示范工程升级版项目(2019BHLC001);烟台大学研究生科技创新基金资助项目(YDZD2113)。

摘　　要：利用生物信息学的方法从藜麦基因组中鉴定得到25个CqYUCCA基因,并对其蛋白信息、进化关系及表达模式进行了系统的分析。结果表明:25个CqYUCCA基因不均匀地分布在藜麦12条染色体上,基因家族亲缘关系显示其编码的蛋白被分成四个亚组,每组的基因结构及蛋白基序的位置、数量均具有较高的相似性。根据已发表转录组数据分析,部分CqYUCCA基因受到干旱、高温以及盐胁迫的诱导。这些结果为进一步研究CqYUCCAs蛋白的生物学功能奠定了基础。25 CqYUCCA genes are identified from quinoa(Chenopodium quinoa Willd.)genome by bioinformatics methods,and their protein information,evolutionary relationships and expression patterns are systematically analyzed.The results show that 25 CqYUCCA genes are unevenly distributed on 12 chromosomes of quinoa.Phylogenetic analysis shows that the proteins are divided into four subgroups,the gene structure and motifs of each group are similar in location and number.Based on published transcriptome data,some CqYUCCA genes are induced by drought,high temperature and salt stress.These results lay a foundation for further studies on the biological functions of CqYUCCAs.

关 键 词：藜麦 生长素 YUCCA 生物信息学 基因家族 

分 类 号：Q751[生物学—分子生物学]